Мир, где живут вместе люди и андроиды под названием неаны. Руж, девушка-неан, вместе со своей напарницей Наоми получает от правительства задание - остановить группировку неанов, известную как Бессмертная девятка.
Первый фильм из полнометражной трилогии расскажет историю феномена «Первое лето любви», который состоялся за 10 лет до начала событий аниме «Эврика 7», но не был описан в сериале полностью.
Далее фильмы будут идти по главной сюжетной линии первого сезона аниме и содержать новые диалоги, сцены, а также новую концовку оригинальной серии «Эврика 7».
Это другая история, берущая начало раньше, чем оригинал. Здесь Сид — по-прежнему человек, Кид еще не поступил в академию, а Медуза работает медсестрой. Главная героиня — оружие Цугуми — еще ни разу не принимала форму оружия. Она встречает двух мастеров — Аню и Мэмэ, и вместе они попадают в класс «НОТ», чтобы научиться контролировать свои силы и работать в команде.
Специальный эпизод «Новый порядок» является неканонической альтернативной концовкой сериала. Впервые был представлен в 2006 году на Sony Music Festival.
Альтернативный финал предполагает, что Эврика должна отправиться в путешествие, чтобы рассеять по всей Земле семь кусков воспоминаний и тем самым успокоить мир. В конце концов, Эврика и Рэнтон должны расстаться, но мальчик клянётся, что они встретятся снова когда-нибудь. 51-й эпизод не имеет отношения к сиквелу «Эврика 7 АО», который начинается с событий, которые произошли в 50-м эпизоде.